Change R to R!H for atoms in 1,4 families

Author: nyee

input/kinetics/families/1,4_Cyclic_birad_scission/groups.py

@@ -31,11 +31,11 @@
     label = "R5JJ",
     group = 
 """
-1 *1 R u1 {2,[S,D]} {5,S}
-2 *2 R u0 {1,[S,D]} {3,S}
-3 *3 R u0 {2,S} {4,[S,D]}
-4 *4 R u1 {3,[S,D]} {5,S}
-5    R u0 {1,S} {4,S}
+1 *1 R!H u1 {2,[S,D]} {5,S}
+2 *2 R!H u0 {1,[S,D]} {3,S}
+3 *3 R!H u0 {2,S} {4,[S,D]}
+4 *4 R!H u1 {3,[S,D]} {5,S}
+5    R!H u0 {1,S} {4,S}
 """,
     kinetics = None,
 )
@@ -45,12 +45,12 @@
     label = "R6JJ",
     group = 
 """
-1 *1 R u1 {2,[S,D]} {5,S}
-2 *2 R u0 {1,[S,D]} {3,S}
-3 *3 R u0 {2,S} {4,[S,D]}
-4 *4 R u1 {3,[S,D]} {6,S}
-5    R u0 {1,S} {6,S}
-6    R u0 {4,S} {5,S}
+1 *1 R!H u1 {2,[S,D]} {5,S}
+2 *2 R!H u0 {1,[S,D]} {3,S}
+3 *3 R!H u0 {2,S} {4,[S,D]}
+4 *4 R!H u1 {3,[S,D]} {6,S}
+5    R!H u0 {1,S} {6,S}
+6    R!H u0 {4,S} {5,S}
 """,
     kinetics = None,
 )
@@ -60,13 +60,13 @@
     label = "R7JJ",
     group = 
 """
-1 *1 R u1 {2,[S,D]} {5,S}
-2 *2 R u0 {1,[S,D]} {3,S}
-3 *3 R u0 {2,S} {4,[S,D]}
-4 *4 R u1 {3,[S,D]} {7,S}
-5    R u0 {1,S} {6,S}
-6    R u0 {5,S} {7,S}
-7    R u0 {4,S} {6,S}
+1 *1 R!H u1 {2,[S,D]} {5,S}
+2 *2 R!H u0 {1,[S,D]} {3,S}
+3 *3 R!H u0 {2,S} {4,[S,D]}
+4 *4 R!H u1 {3,[S,D]} {7,S}
+5    R!H u0 {1,S} {6,S}
+6    R!H u0 {5,S} {7,S}
+7    R!H u0 {4,S} {6,S}
 """,
     kinetics = None,
 )

input/kinetics/families/1,4_Linear_birad_scission/groups.py

@@ -24,10 +24,10 @@
     label = "RJJ",
     group = 
 """
-1 *1 R u1 {2,[S,D]}
-2 *2 R u0 {1,[S,D]} {3,S}
-3 *3 R u0 {2,S} {4,[S,D]}
-4 *4 R u1 {3,[S,D]}
+1 *1 R!H u1 {2,[S,D]}
+2 *2 R!H u0 {1,[S,D]} {3,S}
+3 *3 R!H u0 {2,S} {4,[S,D]}
+4 *4 R!H u1 {3,[S,D]}
 """,
     kinetics = None,
 )