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Commit 4044e76

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Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,5 +1,5 @@
11
Package: BioDataScience1
2-
Version: 2025.8.0
2+
Version: 2025.9.0
33
Title: A Series of Learnr Documents for Biological Data Science 1
44
Description: Interactive documents using learnr and shiny applications for studying biological data science.
55
Authors@R: c(

NEWS.md

Lines changed: 4 additions & 0 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -1,3 +1,7 @@
1+
# BioDataScience1 2025.9.0
2+
3+
- Learnrs **A09La_anova** and **A09Lb_kruskal** revised for 2025-2026.
4+
15
# BioDataScience1 2025.8.0
26

37
- Learnrs **A08La_ttest** and **A08Lb_ttest_wmw** revised for 2025-2026.

inst/tutorials/A09La_anova/A09La_anova.Rmd.inactivated renamed to inst/tutorials/A09La_anova/A09La_anova.Rmd

Lines changed: 35 additions & 1 deletion
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -15,6 +15,40 @@ runtime: shiny_prerendered
1515
```{r setup, include=FALSE}
1616
BioDataScience1::learnr_setup()
1717
SciViews::R("infer", "model", lang = "fr")
18+
# Required for RSConnect
19+
# SciViews::R
20+
library(rlang)
21+
library(data.table)
22+
library(ggplot2)
23+
library(tibble)
24+
library(tidyr)
25+
library(dplyr)
26+
library(dtplyr)
27+
library(broom)
28+
library(forcats)
29+
library(collapse)
30+
library(fs)
31+
library(data.trame)
32+
library(svFast)
33+
library(svTidy)
34+
library(svMisc)
35+
library(svBase)
36+
library(svFlow)
37+
library(data.io)
38+
library(chart)
39+
library(tabularise)
40+
library(SciViews)
41+
# infer section
42+
library(distributional)
43+
library(inferit)
44+
# model section
45+
library(modelit)
46+
# ... more
47+
library(readxl)
48+
library(testthat)
49+
library(equatags)
50+
library(BioDataScience)
51+
library(BioDataScience1)
1852
```
1953

2054
```{r, echo=FALSE}
@@ -37,7 +71,7 @@ BioDataScience1::learnr_server(input, output, session)
3771

3872
Vous avez découvert il y a peu la moyenne et plusieurs tests d'hypothèses associés (différentes variantes du test *t* de Student). Le test *t* de Student indépendant vous permet de comparer les moyennes de deux populations.
3973

40-
Le [module 9](https://wp.sciviews.org/sdd-umons/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons-2024/variance.html) du cours vous explique pourquoi c'est une mauvaise idée de l'appliquer pour comparer plus de deux moyennes simultanément via des comparaisons deux à deux multiples sans précautions particulières.
74+
Le [module 9](https://wp.sciviews.org/sdd-umons/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons-2025/variance.html) du cours vous explique pourquoi c'est une mauvaise idée de l'appliquer pour comparer plus de deux moyennes simultanément via des comparaisons deux à deux multiples sans précautions particulières.
4175

4276
![](images/red-traffic-lights.png){width="10%"}
4377

inst/tutorials/A09Lb_kruskal/A09Lb_kruskal.Rmd.inactivated renamed to inst/tutorials/A09Lb_kruskal/A09Lb_kruskal.Rmd

Lines changed: 35 additions & 3 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -15,8 +15,40 @@ runtime: shiny_prerendered
1515
```{r setup, include=FALSE}
1616
BioDataScience1::learnr_setup()
1717
SciViews::R("infer", lang = "fr")
18-
19-
# dataframe
18+
# Required for RSConnect
19+
# SciViews::R
20+
library(rlang)
21+
library(data.table)
22+
library(ggplot2)
23+
library(tibble)
24+
library(tidyr)
25+
library(dplyr)
26+
library(dtplyr)
27+
library(broom)
28+
library(forcats)
29+
library(collapse)
30+
library(fs)
31+
library(data.trame)
32+
library(svFast)
33+
library(svTidy)
34+
library(svMisc)
35+
library(svBase)
36+
library(svFlow)
37+
library(data.io)
38+
library(chart)
39+
library(tabularise)
40+
library(SciViews)
41+
# infer section
42+
library(distributional)
43+
library(inferit)
44+
# ... more
45+
library(readxl)
46+
library(testthat)
47+
library(equatags)
48+
library(BioDataScience)
49+
library(BioDataScience1)
50+
51+
# Data frame
2052
set.seed(43)
2153
plant <- dtx(
2254
group = as.factor(rep(c("cont", "trt1", "trt2"), each = 30)),
@@ -52,7 +84,7 @@ Dans ce tutoriel, vous allez pouvoir auto-évaluer votre capacité à :
5284
- Déterminer quand utiliser un test de Kruskal-Wallis à la place de l'ANOVA à un facteur
5385
- Utiliser ce test non paramétrique pour résoudre des questions pratiques en biologie
5486

55-
N'entamer ce tutoriel qu'après avoir compris ce qu'est une ANOVA à un facteur présentée dans le [module 9](https://wp.sciviews.org/sdd-umons/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons-2024/variance.html) du cours et vous être auto-évalué via le learnr **A09La_anova** intitulé "ANOVA à un facteur et tests post-hocs".
87+
N'entamer ce tutoriel qu'après avoir compris ce qu'est une ANOVA à un facteur présentée dans le [module 9](https://wp.sciviews.org/sdd-umons/?iframe=wp.sciviews.org/sdd-umons-2025/variance.html) du cours et vous être auto-évalué via le learnr **A09La_anova** intitulé "ANOVA à un facteur et tests post-hocs".
5688

5789
## Situation
5890

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